Enterprise Architectでパッケージ内やダイアグラム上の要素間の関係などを
マトリックスで表示する「拡張マトリックスアドイン」のバージョン0.5.0.0
を公開しました。

https://www.sparxsystems.jp/products/EA/tech/Addins.htm#MatrixEX

Enterprise Architect標準の関係マトリックスではできない、要素がどのダイアグラムに
配置されているかの確認や、ソース(縦軸)のツリー表示、条件指定したい要素・接続の種類
を外部ファイルで追加、などができます。

せひお試しください。