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Wine環境で利用するEnterprise Architectで、Subversionを利用しバージョン管理機能を利用する場合の手順は、Windows環境で利用する場合と基本的には同じです。ただし、Wine環境で利用する場合には、SubversionクライアントはWindows版を利用し、Wine上で動作させる必要があります。
異なる点は、Subversionの作業コピーを準備する際の手順となります。具体的には、Subversionリポジトリから作業コピーを作成する手順が異なります。
詳細は、「Linux/macOS環境でのSubversionの利用について」 のページをご覧ください。